CSDCore是基础模块,它提供基于文本和分子结构的检索服务,同时支持晶体三维结构的可视化和分析。值得一提的是,其中的Mercury模块能够支持3D打印模型文件的直接导出。CSDDiscovery模块专注于药物发现领域,提供蛋白-配体复合物的查询、利用GOLD程序进行分子对接和分子构象生成等功能。GOLD对接功能还可以通过Azure云平台进行部署。CSDMaterials模块则针对材料科学研究,提供分子结构的详细分析与预测、分子间相互作用和晶体堆积模式分析等功能。
用户可以直接下载CSD中的单个结构数据,但批量下载需要购买相应的许可。此外,CSD的一些高级功能需要用户订阅才能使用,而通过CSDEnterprise软件的程序查询接口则需要用户购买相应的服务。对于用户尚未发表的分子结构数据,可以通过CSD的通信渠道直接发布到数据库中。
2、MolAid化合物智能检索一体化平台
综合推荐指数:★★★★★
简介:MolAid拥有一个功能强大的化合物晶体数据库,它为化学研究者提供了一个全面而专业的晶体资源平台。输入任意晶体结构信息就能匹配相关化合物。通过研究晶体信息,揭示物质微观结构与宏观性质之间的关系,利于推动新型材料发展、促进药物晶型新发现。该数据库收录了超过100万+晶体信息,这些晶体信息极大地方便了化学结构的解析和化合物的鉴定工作。
特点:
检索信息丰富:能够知晓化合物晶胞棱长(轴长)、晶胞轴角、空间群、晶胞体积、环境衍射温度等信息。值得一提的是能知晓该信息的参考文献来源。
数据可视化与交互:MolAid的晶体数据支持可视化操作,支持3D结构样式切换,3D 展示界面可以任意拖动、调节大小。用户可以通过悬停交互多角度的查看晶体的空间结构,这种直观的展示方式使得数据分析更为便捷和准确。
便捷的下载图像:用户可以导出图像,支持GIF、JPG、PNG等格式,也支持3D模型的导出。这极大地方便了数据的进一步处理,提高了研究效率。
专业的事实依据:MolAid提供的晶体数据为未知结构的解析和化合物结构的判断提供了专业且可靠的事实依据,这对于化学研究和工业应用中的结构鉴定至关重要。
晶体反向检索:MolAid 支持通过晶体信息查询化合物,输入任意晶体结构信息(化学式、DOI、空间群、晶胞体积、a/nm、α/°、b/nm、β/°、c/nm、γ/° )就能匹配相关化合物。这一功能特别有助于解析复杂的化学结构,使得研究者能够更加轻松地进行化合物的鉴定和结构解析。
用户友好的设计:MolAid的界面设计注重用户体验,使得操作直观易懂,即便是初学者也能快速上手,有效降低了学习曲线,提高了工作效率。
MolAid也可以查询谱图信息哦~
3、上海有机所化学专业数据库
综合推荐指数:★★★★★
简介:化学专业数据库是中科院上海有机化学研究所承担建设的综合科技信息数据库的重要组成部分。上海有机化学研究所的数据库群是服务于化学化工研究和开发的综合性信息系统, 可以提供化合物结构与鉴定、天然产物与药物化学、安全与环保、化学文献、化学反应与综合信息。关于化学结构与鉴定方面,包含化合物结构数据库、核磁谱图数据库、质谱谱图数据库、红外谱图数据库、物化性质数据库、农药高分辨质谱数据库、晶体结构数据库、含能材料数据库。
特点:其中,晶体结构数据库属上海有机所化学专业数据库系统的一部分,本数据库共收录今年来多个文献发表的晶体数据,包括其化合物结构、名称等。 总共包括10万多化合物的晶体结果。用户可通过输入化合物结构来检索数据库中的物质,或通过设定晶胞参数的数值范围, 筛选出目标化合物。
4、Crystallography Open Database(COD)
综合推荐指数:★★★★★
简介:晶体开放数据库(COD),诞生于2003年,是免费的、支持开放获取,为科研人员提供了一个包含有机、无机、金属有机及矿物质结构的丰富数据库。该数据库由立陶宛维尔纽斯大学的Gra2ulis教授团队负责维护,并且已经在包括法国和西班牙在内的多个国家设立了镜像站点,以提升全球范围内的访问速度和稳定性。
COD的数据来源广泛,既包括国际晶体学联合会的权威数据,也涵盖了众多科学文献中发表的结构信息。截至目前,数据库已收录了超过48万分子结构。值得注意的是,早期文献中的数据经过了人工审核,确保了数据的准确性。此外,用户还可以上传他们尚未发表的结构数据,进一步丰富数据库的内容。
特点:COD的官方网站提供了多种便捷的功能,包括数据的浏览、搜索和下载。用户可以根据数据发表的期刊或年份进行浏览,而搜索功能则允许用户通过多种方式查找所需的结构,如通过COD ID、SMILES字符串、期刊名称、化学式、元素组成或晶体的晶格参数等。为了提供更直观的搜索体验,用户甚至可以通过绘制二维结构图来执行搜索。
在单个结构的详细页面上,用户可以查看到包括三维结构视图、分子名称、相关文献、晶体学数据以及结构的历史版本等详细信息。
与晶体学结构数据库(CSD)相比,COD的一个显著优势在于其开放获取的特性。用户可以无需注册账户,即可免费下载所有分子结构数据和SQL格式的数据库文件,这大大简化了数据获取的过程。此外,COD还提供了基于RESTful API的查询接口,为程序开发者提供了便利,使他们能够通过编程方式高效地访问和利用数据库中的信息。
5、ICSD无机晶体结构数据库
综合推荐指数:★★★★
简介:ICSD(无机晶体结构数据库)是世界上最大的无机晶体结构数据库,ICSD无机晶体结构数据库是获取晶体学科学信息的必备工具。由德国FIZ Karlsruhe提供,几乎包含了所有已知无机晶体结构的数据。它包含了详细的无机化合物晶体结构数据,对于研究无机化学和材料科学的人来说非常有价值,尤其是对于固态化学和物理性质的研究。
特点:它专注于收集和提供除了金属和合金以外、不含C–H键的所有无机化合物晶体结构信息。包含的信息有化学名和化学式、矿物名和相名称、单位晶胞、空间群、原子参数、热参数、位置占位度、R因子以及相关文献等多个方面。ICSD数据库的历史可以追溯到1913年,目前包含近30万个晶体结构。每年新增约12000种新化合物。通过持续质量保证,对现有内容进行修改、补充或删除重复内容。数据经由专业专家记录,并经过多次修正,使其成为国际上最具权威性的无机晶体结构数据库之一。
谱图数据库:
1、中科院长春应用化学研究所应用化学数据库
综合推荐指数:★★★★
简介:碳-13核磁共振波谱数据库是中科院长春应用化学研究所承担建设的综合科技信息数据库的重要组成部分,是中科院知识创新工程信息化建设的重大专项。
碳-13核磁共振波谱数据库系统始建于1982年,它是国内第一个比较大型的碳-13 NMR数据库系统,主要用于有机化合物结构的自动解析。谱图信息如化学位移检索是碳13NMR数据库检索中的重要内容。系统允许单峰检索,同时允许多个峰值一起即相似性检索。单峰检索要求使用者对碳13NMR谱有较多的了解,这样才能够选取较“特征”的峰,以使检索高效。
2、 北京微量化学研究所分析中心
综合推荐指数:★★★★
简介:该中心拥有的Sadtler(萨特勒)红外光谱数据库共计13万3千多张,其中凝聚相纯化合物标准红外光谱库74126张,气相纯化合物标准红外光谱库9350张,其余的按化合物类型和用途分类如下:农业化学,粘合剂,多元醇,表面活性剂,聚合物,高聚物裂解产物。我们可以在Sadtler(萨特勒)红外光谱数据库中进行全光谱检索,峰表检索,化合物名称,分子量,分子式,CAS登记号,熔点,沸点等物性检索。
3、NIST的Chemistry Web Book
综合推荐指数:★★★★
简介:美国国家标准与技术研究院NIST的基于Web的物性数据库Chemistry Web Book可以看作是NIST的标准参考数据库Standard ReferenceData中一部分与化学有关的数据库的Web版本,可通过分子式检索、化学名检索、CAS登录号检索、离子能检索、电子亲和力检索、质子亲和力检索、酸度检索、表面活化能检索、振动能检索、电子能级别检索、结构检索、分子量检索和作者检索等方法,得到气相热化学数据、浓缩相热化学数据、相变数据、反应热化学数据、气相离子能数据、离子聚合数据、气相IR色谱、质谱、UV/Vi色谱、振动及电子色谱等。
4、Spectral Database for Organic Compounds,SDBS
综合推荐指数:★★★★★
SDBS由日本国家先进工业科学技术研究所创办,是一个比较综合的有机化合物的光谱数据库系统,它包含7种不同类型的光谱图。其中有EI-MS,FT-IR,1H-NMR,13C-NMR,Laser Raman, ESR谱图。从1997年开始,SDBS免费向公众开放。(该网站可以用CAS号搜索,对毒性研究的同学很nice!该数据库有英文和日文版本的哦)
到2019年为止已收载谱图数目如下:
总的化合物34600多种
质谱图谱25000张
1H-NMR谱15900张
13C-NMR谱14200张
FT-IR图谱54100张
Raman谱3500张
ESR谱2500张
5、Organic compounds Database
综合推荐指数:★★★★
简介:OrganiccompoundsDatabase包含有2483个化合物,是由哈佛大学弗吉尼亚研究所编撰的。在主页的信息框内填入你知道的尽可能多的数据项,不知道或不确定的项目可以不填,然后点击submit按钮来开始你的搜索,你能获得至少20条项目,可以搜索到的条目包括InfraredSpectra(红外), Physical Properties(物理性质), NMR Spectra(核磁), Mass Spectra(质谱),Ultraviolet Spectra(紫外)。
当使用这些数据库时,可以根据个人需求选择最适合的数据库进行查询。同时,也欢迎大家来补充哦~返回搜狐,查看更多